メガミリオンは、１０人の女神から１人を選び、ゲーム中にカードを集めながらいち早く女神を覚醒（レベルアップ）させることで、勝利へと導いていくデッキ構築型カードゲーム（※）です。
※デッキ構築型カードゲームとはゲーム上に用意されたカードを集めて、デッキ（自分が使うカードセットのこと）を作りながら、勝利を目指すカードゲームのこと。
用意されるカードの種類が変わることで、毎回違う展開を楽しむことができる。
最初に選択する女神以外は、平等の条件で戦うのが特徴となります。
メガミリオンでは、女神たちの物語を楽しむことのできる『物語』と、
自由に対戦ができる『対戦』の２種類を楽しめます。
『対戦』では、CPU戦の他、Game Centerの機能を使用した
通信対戦も可能です。
『物語』『対戦』共に、自分の使用する女神を選択します。
『物語』では、対戦相手毎にゲームで使用される使徒が決まっており、対戦を行なっていきます。
『対戦』では、ゲームで使用する使徒を自分で選ぶことができます。
通信対戦時は、部屋を立てるプレイヤーがゲームに使用する使徒を選びます。
1：現在のフェーズ名
2：情報領域
・手札 → 手札の枚数
・山札 → 山札の枚数
・捨札 → 捨札の枚数
・Lv → 現在のレベル
・覚醒値 → 現在の覚醒値／次のレベルに必要な覚醒値
3：召喚エリア
4：残り召喚回数
5：召喚に必要な召喚力
6：残カード数
7：消費できる残り神力
8：消費できる残り召喚力
9：メニューボタン
10：完了ボタン
11：行動エリア
12：手札
13：使用時に消費される神力
14：所持枚数
15：カード名
小さい状態のカードをタップすると、拡大したカードを見ることができます。
1：カードタイプ
2：所属国
3：情報：各女神の効果です。
4：神力：１ターンに使用できる神力の量です。
5：覚醒：次のレベルに上がるために必要な覚醒値です。
1：カードタイプ
2：所属国
3：情報：各使徒の効果です。
4：消費神力：使徒を使用するときに、消費する神力の量です。
5：消費召喚力：使徒を召喚するときに、必要な召喚力の量です
1：カードタイプ
2：情報：カードが保有する召喚力の量です。
3：消費召喚力：魂を召喚するときに、必要な召喚力の量です。
1：カードタイプ
2：情報：カードが保有する覚醒値の量です。
3：召喚：禊地を召喚するときに、必要な魂の量です。
メガミリオンはターン制でゲームが進行します。
1ターンは、以下の４つのフェーズに別れています。
行動フェーズ
召喚フェーズ
奉納フェーズ
浄化フェーズ
行動フェーズでは下記の行動を行えます。
１：手札にある使徒カードを使用する。
２：【奇跡】に分類される、女神の能力を使用する。
手札に使徒カードがあり、必要な神力が残っていれば
「行動エリア」に使徒カードをドラッグすることで、使用することができます。
各使徒カードを使用するために必要な神力は、手札にある使徒カードの左上に記載されています。
現在の神力は「行動エリア」の左上に「神力：XX」の形で表示されています。
手札に使徒カードが存在しない、存在していても神力が足りない場合は、召喚フェーズに進みます。
召喚フェーズでは下記の行動が行えます
１：召喚力の分だけ、使徒・土地（聖）・魂カードを召喚できる。
召喚できるカードは、召喚エリア上で光っています。
必要なカードを手前にドラッグすることで、カードを召喚してデッキに入れることができます。
召喚したカードは、捨札になります。
１：手札にある土地（聖）カードの分、覚醒値が溜まります。
２：レベルアップに必要な覚醒値を超えたら、レベルアップします。
このフェーズは自動で進みます。
１：使った使徒カードや、手札のカードをすべて捨札にする。
２：山札のカードを、５枚引く。
※山札にカードがない場合は、捨札のカードをシャッフルして新しい山札を作る。
いずれかの女神がLv3になる、または300ターンが経過するとゲーム終了となります。
Lv3になった女神は1位となり、それ以外の女神は覚醒値の高い順に順位が付けられます。
300ターン経過時は、覚醒値の高い順に順位が付けられます。
終了時にはGが与えられます。
Gはショップでカードを獲得するのに使用します。
ゲーム中に貯めたGもしくは課金によって、新しくゲームで使用できるカードを獲得します。
Gと課金両方で獲得できるもの、Gのみで獲得できるもの、課金のみで獲得できるものがあります。
| デッキ | プレイヤーが使用するカードセット。 「土地（聖）『陣』」が３枚、「緑魂」が７枚の状態でゲームがスタートする。ゲーム中に各カードを召喚することで増えていく。 |
| 女神カード | ゲーム開始前に選択する、強力な能力を持ったカード。 能力は効果に応じて【常時】【奇跡】に分類される。 |
| 【常時】 | ゲーム中、使用しなくても効果を発揮する女神能力のこと。 |
| 【奇跡】 | ゲーム中、条件が満たされている時に行動フェーズにて使用することで、効果を発揮する女神能力のこと。 |
| 使徒カード | 行動フェーズ中に、神力を消費して使用することのできるカード。 通常効果に加え【妨害】【結界】の属性を持つカードがある。 |
| 【妨害】 | 他のプレイヤーに対して不利な効果を及ぼすカード。 |
| 【結界】 | 【妨害】属性のカードを使用された時に公開することで、【結界】効果を得ることのできるカード。 |
| 魂カード | 各カードを召喚するために必要な召喚力を供給するカード。 |
| 土地（聖）カード | 奉納フェーズにて、女神の覚醒値を貯めることのできるカード。 |
| 土地（邪）カード | 奉納フェーズにて、女神の覚醒値を減らすカード。 |
| 召喚エリア | 召喚できるカードが置かれている領域。 |
| 召喚 | 召喚エリアにあるカードを自分のデッキに入れる行為。召喚したカードは、捨札になる。 |
| 破壊 | デッキから、カードを除外する行為のこと。 |
| 山札 | 手札に入れる前の状態のカードの束。 伏せられており、特定の使徒カードや女神の能力以外では見ることはできない。 山札がなくなった場合、捨札をすべてシャッフルして新たな山札を作る。 |
| 手札 | この状態にあるカードのみ使用したり、効果を発揮することできる。 |
| 捨札 | 使用済みのカード。 特定の使徒カードや女神の能力以外では、見ることはできない。 |